Son départ le 6 août 2015 de l'Olympique de Marseille, où il était l'adjoint de Marcelo Bielsa, avait été le premier signal de ce qui se tramait dans les coulisses. Jan van Winckel, c'est de lui qu'il s'agit, avait en effet préféré quitter le club phocéen avant d'être imité quelques jours plus tard par l'entraîneur argentin. Mais en un an passé sur le banc de l'OM à côté d'El Loco, mais aussi de Franck Passi, van Winckel a beaucoup appris sur le club phocéen et sur les méthodes de celui qui par deux fois a été nommé pour remplacer d'abord Marcelo Bielsa, puis Michel. Et se confiant dans L'Equipe, Jan van Winckel estime que les dirigeants de l'Olympique de Marseille n'ont aucune hésitation à avoir concernant le futur entraîneur.
« Il y a cinq qualités à avoir pour un coach. Être capable de diriger une séance d'entraînement, avoir une bonne image, savoir manager un groupe, être capable d'intégrer et de faire progresser des jeunes, et enfin "performer" par rapport au budget. Sur ce dernier point, on ne sait pas mais Franck a toutes les autres qualités. Si j'étais dirigeant à Marseille, je lui donnerais sa chance sur le long terme », conseille celui qui est désormais conseiller technique de la Fédération d’Arabie Saoudite. Reste à savoir à qui appartiendra l’Olympique de Marseille lorsque le championnat 2016-2017 reprendra…