Le nom de Didier Deschamps est revenu plusieurs fois dans les écoutes téléphoniques réalisées dans le cadre de l'affaire des transferts douteux à l'Olympique de Marseille. Et du côté de Jean-Claude Dassier et Antoine Veyrat on reproche à l'ancien entraîneur de l'OM d'avoir menti en affirmant qu'il ne savait rien des opérations en cours et à venir pour renforcer le club phocéen. Pour cela, l'ancien directeur général de Marseille a remis au juge deux papeboards écrits de la main de Didier Deschamps où l'on trouve les noms des joueurs visés, ainsi que les prix et les salaires de ces derniers.
Interrogé par le Journal du Dimanche, celui qui est désormais sélectionneur national admet que ces documents sont réels, mais il se défend d'avoir une quelconque implication dans toutes ces histoires. « Je ne me souvenais pas de cela, mais c’est bien mon écriture. Je pense que c’était une réunion technique avec Pape Diouf et Julien Fournier, en prévision de la saison à venir avec des joueurs susceptibles de partir et d’arriver. Mais en aucun cas je ne peux laisser dire que je connaissais les montants des salaires et des transferts! Ces informations m’étaient données par les dirigeants. Moi je disais les joueurs que je souhaitais, c’est tout. J’affirme que je ne me suis jamais occupé d’une négociation de transfert ni d’un montant de salaire de joueur! C’était le travail des dirigeants », a précisé Didier Deschamps, qui conteste également des soupçons de malversations lors de son départ de l’Olympique de Marseille en 2012.