Après son clash avec Didier Deschamps, José Anigo semble avoir trouvé un nouvel ennemi en la personne de Mehdi Benatia. Le défenseur de l'Udinese, qui a vécu sa formation en région parisienne avant de la conclure à l'OM, n'a pas du tout apprécié le comportement du directeur sportif marseillais, qui ne lui a pas fait confiance après que le jeune joueur ait signé son premier contrat pro en 2005. Anigo avait en effet empêché le jeune joueur de rejoindre un autre club de l'élite alors qu'il en avait l'opportunité.
« Je me rappelle de l’histoire des minots qui étaient montés au Parc des Princes pour affronter Paris (0-0 en 2006, ndlr). J’avais été le seul à ne pas être convoqué. A ce moment, José Anigo était au club. Donc, oui, je lui en veux beaucoup. (…) Après, je voulais partir à Saint-Etienne et Elie Baup me voulait, mais José me dit alors : ‘Non, tu ne pars pas. Si tu pars, c’est en Ligue 2’. C’est dur à comprendre pour un joueur de 18 ans qui n’avait pas sa place à l’OM. Derrière, il m’envoie galérer en Ligue 2 pour que je ne puisse pas réussir dans un autre club de Ligue 1. Il m’a fait perdre deux ou trois ans de ma vie. A l’époque, il y a eu beaucoup de choses dures à comprendre », a confié sur RMC celui qui a été élu meilleur défenseur de Série A la saison dernière et qui avait donc dû poursuivre sa carrière à Clermont Foot, en Ligue 2, après avoir été prêté à plusieurs reprises par l'OM.