Recruté le 14 août 2015 par l'Olympique Lyonnais à l'AS Rome pour 8ME plus 2ME maximum de bonus, Mapou Yanga-Mbiwa n'était pas réellement le premier choix du club rhodanien, qui à l'époque avait tout fait pour recruter Nicolas Nkoulou sans y parvenir. A l'époque les supporters de l'OL avaient en majorité toussé devant ce recrutement du défenseur de la Roma. Et les premiers mois avaient donné raison à ces derniers, Mapou Yanga-Mbiwa étant totalement fantomatique sous le maillot lyonnais. Mais loin de s'affoler, le défenseur de 27 ans avait réussi à faire taire les sifflets de Gerland, pour devenir même un des chouchous du public lyonnais. Encore lié quatre saisons avec l'OL, Mapou Yanga-Mbiwa s'éclate dans la capitale des Gaules au point de d'ores et déjà envisager de prolonger son bail avec le club de Jean-Michel Aulas.
C'est du moins ce qu'il a confié sur FootMercato. « Je suis venu ici car le projet était très très intéressant, le président a réussi à convaincre ma famille et moi-même de venir ici car il y a des très bonnes choses à faire et Lyon veut retrouver la lumière qu'il y avait avant. Pour l'instant ça se passe bien. Les deux dernières saisons, on a fini deuxième, pourquoi pas deuxième encore cette année et si on peut finir premier, on finira premier. Je cherche la stabilité, Lyon est un très grand club en France qui n’a rien à envier aux autres clubs à l’étranger », qui ne voit donc aucune raison de quitter l'Olympique Lyonnais.