Avec l'absence prolongée de Marc Planus, Fernando est contraint de poursuivre son intérim en défense centrale à Bordeaux. Un rôle qu'il n'envisageait pas de tenir avec les Girondins, mais où il s'est en tout cas révélé précieux depuis le début de saison pour Jean Tigana. Pourtant, le Brésilien affirme que tout est loin d'être parfait pour lui à ce poste. Il rappelle ainsi qu'il a encore « des difficultés pour tenir ce poste à risque » et qu'il est loin d'y être tout à fait à son aise, puisqu'il avoue avoir « toujours la boule au ventre avant le coup d’envoi » avant de « s’accrocher pendant tout le match ».
En tout cas, les chiffres sont implacables: les Girondins encaissent moins de buts avec Fernando aux cotés de Ciani. « Ça m’étonne. Et cela ne me pousse pas pour autant à penser me reconvertir à ce poste » clame le Brésilien, qui ne voit toutefois pas que des désavantages à ce nouveau rôle au sein des Bordelais. Promu capitaine pendant la suspension d'Alou Diarra, Fernando profite de ce recul sur le terrain pour prendre son rôle très à coeur. « Jouer derrière m’offre aussi plus de temps pour remplir mon rôle de capitaine. Au milieu, c’est plus difficile. Tu es toujours en train de courir » concède le milieu de terrain de formation, qui doit attendre avec impatience le retour au premier plan de Marc Planus, toujours en délicatesse avec son genou.