Dans une situation pas loin d’être désespérée au classement, puisque l’AJA est dernière avant de se déplacer à Marseille et de recevoir Montpellier, Auxerre est également dans une situation financière complexe. Le club bourguignon avait en effet calculé son budget en considérant qu’il allait finir à la sixième place de Ligue 1, un doux rêve qui tourne au cauchemar. Selon l’Equipe, le déficit qui devait être de 7,8ME va plus que doubler et atteindre 18ME à la fin de la saison. Ajoutons à cela un possible passage par la Ligue 2, qui serait évidemment un autre coup dur pour les caisses de l’AJA et forcément la question de l’avenir du club dans sa configuration actuelle se pose. Afin de trouver un repreneur, les dirigeants bourguignons réfléchiraient à abandonner leur structure actuelle, à savoir être le seul club pro détenu à 99% par une association. Le quotidien sportif affirme qu’Auxerre pourrait ouvrir très largement son capital à des repreneurs extérieurs, même si cette idée ne fait pas l'unanimité.
En attendant, le club icaunais s’est mis en quête de joueurs qui pourraient bénéficier des installations et du savoir-faire du futur centre de formation auxerrois, lequel sera ouvert début 2013, moyennant finance. Plusieurs pays de l’Est et d’Asie seraient prêts à payer Auxerre pour accueillir de jeunes joueurs à former, ce qui serait évidemment une bonne bouffée d’oxygène pour le club.
