Têtes de série (12 vainqueurs de poule d’Europa League, et les quatre meilleurs troisièmes des poules de Ligue des Champions) :
Porto, Olympiakos, Manchester United, Leverkusen, Molde, Liverpool, Krasnodar, Naples, Rapid Vienne, Braga, Lazio Rome, Bâle, Atletic Bilbao, Lokomotiv Moscou, Tottenham, Schalke 04
Non têtes de série : Séville, Valence, Galatasaray, Shakhtar Donetsk, Fenerbahçe, Sion, Dortmund, Midtjylland, Villareal, OM, Saint-Etienne, Sporting Portugal, Fiorentina, Anderlecht, Sparta Prague, Augsbourg.
- les clubs d'une même association ne peuvent se rencontrer.
- les membres d'un même groupe ne peuvent se rencontrer.
- une tête de série est toujours opposée à une non-tête de série.
- le match retour a lieu au domicile du club tête de série.